HAK stráca účinnosť vtedy, ak antibiotiká ovplyvnia črevnú flóru, alebo ak máte napríklad poruchu trávenia, hnačku alebo zápal žalúdka. Keďže prakticky všetky antibiotiká ovplyvňujú črevnú flóru, odporúča sa počas ich užívania chrániť sa aj inou metódou antikoncepcie. Súčasne užívať B-komplex a jogurty s kultúrami živých probiotických baktérií (Actimel, Activia). Na podobnú otázku odpovedal nedávno aj gynekológ. Lieky ktoré uvádzate sú najmä protizápalové a pokiaľ nespôsobia zápal žalúdka alebo čreva, nemajú vplyv na vstrebávanie antikoncepčných piluliek.